Le Conseil d’administration est investi d'un rôle initiateur. Il fixe le budget de l'Agence, émet les propositions sur l'extension du réseau des Attachés économiques et commerciaux, élabore le Programme d'actions pour les exportateurs wallons.

Dans la logique du rapprochement initié en 1998 entre les différents départements en charge des matières internationales de la Région wallonne et de la Communauté française, l'Administrateur général de l'Agence est aussi responsable de Wallonie-Bruxelles international (WBI) héritier du CGRI et de la DRI.